بررسی کاستهای ژنی اینتگرون کلاس 1، شناسایی ژن های مقاومت به تتراسایکلین(a-d) و ژنوتایپینگ ایزوله های بالینی مقاوم به تتراسایکلین انتروپاتوژنیک اشریشیاکولای
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
- نویسنده اعظم محمودی ازناوه
- استاد راهنما بی تا بخشی شهین نجارپیرایه
- سال انتشار 1392
چکیده
انتروپاتوژنیک اشریشیا کلی (epec=enteropathogenic escherichia coli) به عنوان مهم ترین عامل اسهال در کودکان است. پاتوژنز انتروپاتوژنیک اشریشیاکلی که پاتوواری از اشریشیاکلی است لزیون های a/e (attaching and efacing) است که در بیوپسی روده بیمار نیز دیده می شود. این لزیون ها توسط ژن هایی کد می شود که روی جزیره ژنومی lee (locus of enterocyte effacement) قرار دارد. شناسایی epec با استفاده از تشخیص این ژن به وسیله پرایمر های اختصاصی صورت می گیرد. ژن bfpa کدکننده bundle-forming pili برای تمایز سویه های تیپیک و آتیپیک epec از هم استفاده می شود. هدف این شناسایی epecهای تیپیک و آتیپیک و بررسی حضور ژن های مقاومت به تتراسایکلین و تعیین کاست های ژنی اینتگره شده در اینتگرون کلاس یک و دو و ژنوتایپینگ ایزوله های مقاوم به تتراسایکلینepec است. تعداد 349 اشریشیاکلی جدا شده از کودکان که با استفاده از تست های بیوشیمیایی تایید شده اند، در این مطالعه مورد بررسی قرار گرفته اند. تشخیص سویه های epec با استفاده از روش pcr و پرایمرهای اختصاصی ژن eae وstx انجام شد. سپس ایزوله ها از لحاظ وجود ژن های bfpa و مقاومت به تتراسایکلین(a-d) و وجود اینتگرون کلاس یک و دو مورد بررسی قرار گرفتند. برای بررسی تنوع ژنتیکی ایزوله های مقاوم به تتراسایکلین از تکنیک pfge (pulsed-field gel electrophoresis) استفاده شد. در مجموع تعداد 30 ایزوله epec در این مطالعه یافت شد که تنها یک ایزوله حاوی ژن bfpa بود و به عنوان تیپیک شناسایی شد. از بین 30 ایزوله (30%)9 حاوی اینتگرون کلاس یک و (6.6%) 2 حاوی اینتگرون کلاس دو بودند. تکثیر ناحیه داخلی در اینتگرون کلاس یک وجود دو کاست ژنی dfra7 و dfra1–aada1 را با باندهای به ترتیب 750bp و 1500bp در 44.4% و 33.3% از ایزوله های حاوی اینتگرون نشان داد. کاست های ژنی تکثیر شده در اینتگرون کلاس دو، واجد ژن های مقاومت dfra1-sat1-aada1 و dfra1-sat1 با باند های 1300bp و2500bp بودند. بیش ترین ژن های مقاومت به تتراسایکلین از نوعteta و tetb بود که هر کدام در 6 ایزوله (20%) یافت شدند. ژن tetc در دو ایزوله و ژن tetd تنها در یک ایزوله یافت شد. هیچ پالسوتایپ مشابهی در سویه های واجد اینتگرون و یا سویه های مقاوم به تتراسایکلین مشاهده نشد. نتایج این مطالعه نشان دهنده کاهش شیوع ایزوله های تیپیک و گرایش ایزوله ها به سمت آتیپیک شدن در میان ایزوله های epec در ایران است. شیوع اینتگرون کلاس یک در میان ایزوله ها نسبت به مطالعات انجام شده در سال های گذشته کاهش پیدا کرده است. نتایج ژنوتایپینگ نشان داد که ایزوله های epec مقاوم به تتراسایکلین جدا شده از کودکان مبتلا به اسهال یک جمعیت هتروژن را تشکیل می دهند.
منابع مشابه
بررسی کاست های ژنی اینتگرون کلاس 1، شناسایی ژن های مقاومت به تتراسایکلین (a-d) و ژنوتایپینگ ایزوله های بالینی مقاوم به تتراسایکلین سالمونلا و شیگلا
مقدمه: باکتر?های سالمونلا و شیگلا از پاتوژن های مهم روده ای بوده و به ترتیب موجب ب?مار?های حصبه و اسـهال (اسـهال خـون? ) می شوند. بیماری های اسهالی در بسیاری از کشورهای دنیا به ویژه کشورهای در حال توسعه یکی از عوامل مهـم مـرگ و میـر بـه حساب میآیند. اهداف: هدف این مطالعه نشان دادن میزان شیوع ژن های مقاومت به تتراسایکلین، بررسی کاست های ژنی اینتگره شده در اینتگرون های کلاس i و ii و ژنوتایپینگ ج...
شناسایی مقاومت القایی به کلیندامایسین در ایزوله های بالینی استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین به روش D-zone Test
مقدمه و هدف: با افزایش بروز انواع عفونت های ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس به ویژه سویه های مقاوم به متی سیلین (MRSA)، استفاده از آنتی بیوتیک های موثری همچون کلیندامایسین و اریترومایسین، به منظور درمان عفونت های سیستمیک و موضعی ایجاد شونده توسط این ارگانیسم را بیشتر کرده است. با این حال، نگرانی از احتمال ظهور مقاومت به کلیندامایسین در طی درمان، برخی از پزشکان را از تجویز آن دلسرد می کند. هدف از ا...
متن کاملبررسی و شناسایی ژن های مقاومت به تتراسایکلین در سویه های اشریشیاکلی انتروپاتوژنیک جدا شده از نمونه های اسهال کودکان به روش Multiplex PCR و تعیین مقاومت آنتیبیوتیکی
مقدمه: برخی از سویه های پاتوژنیک اشریشیاکلی می توانند باعث ایجاد بیماری های روده ای و خارج روده ای شوند. اشریشیاکلی انتروپاتوژنیک مهم ترین عامل اسهال کودکان کشورهای در حال توسعه است. هدف از این مطالعه، تعیین میزان شیوع مقاومت آنتی بیوتیکی و توزیع فراوانی ژن های مقاومت به تتراسیکلین در اشریشیاکلی مولد اسهال می باشد. مواد و روش ها: تعداد 150 نمونه مدفوع اسهالی کودکان زیر 5 سال از مراکز در...
متن کاملشناسایی مقاومت القایی به کلیندامایسین در ایزوله های بالینی استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین به روش d-zone test
مقدمه و هدف: با افزایش بروز انواع عفونت های ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس به ویژه سویه های مقاوم به متی سیلین (mrsa)، استفاده از آنتی بیوتیک های موثری همچون کلیندامایسین و اریترومایسین، به منظور درمان عفونت های سیستمیک و موضعی ایجاد شونده توسط این ارگانیسم را بیشتر کرده است. با این حال، نگرانی از احتمال ظهور مقاومت به کلیندامایسین در طی درمان، برخی از پزشکان را از تجویز آن دلسرد می کند. هدف از ا...
متن کاملبررسی فراوانی ژن های کد کننده مقاومت به آمینوگلیکوزیدها در ایزوله های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین جدا شده از نمونه های بالینی
Background and purpose: Aminoglycosides are broad-spectrum antibiotics that are often used in combination with other antibiotics for the treatment of severe S. aureus infections. This research aimed at investigating the phenotypic and genotypic evaluation of aminoglycoside resistance in clinical isolates of MRSA in Kerman, Iran. Materials and methods: During a one...
متن کاملفعالیت و بیان ژن پمپ افلاکس norA در ایزوله های بالینی استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به سیپروفلوکساسین
سابقه و هدف: یکی از مکانیسم های مقاومت باکتری استافیلوکوکوس اورئوس به آنتی بیوتیک ها از جمله سیپروفلوکساسین، وجود پمپ های افلاکس همانند norA می باشد. در این مطالعه وجود پمپ های افلاکس norA، بیان و فعالیت آن در سویه های مقاوم به سیپروفلوکساسین استافیلوکوکوس اورئوس مورد مطالعه قرار گرفت. مواد و روشها: در این مطالعه تجربی، تعداد 250 نمونه بالینی خون، ادرار، زخم و نای از بیماران بستری در چند بیما...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023